海埔排水為將軍溪排水系統之麻豆排水的支流，排水路總長約1.68公里，為麻豆排水重要支流之一；由於現況排水路通水斷面不足、河道淤積、橋樑樑底過低及堤岸高程不足等因素，加上中、下游地勢較為低窪屬感潮區，每逢颱風豪雨期間，常因外水頂托導致溢頂漫流，內水不易排除，造成上游社區聚落淹水。
有鑑於此，經臺南市政府水利局提報整治需求，向水利署前瞻基礎建設計畫爭取相關經費，擬將階段性治理海埔排水之整治工作，藉由河道斷面拓寬及新建護岸以改善周遭淹水情況。海埔排水整治工程依據治理規劃報告拓寬至10~12公尺，下游段計畫堤頂以背水堤型式設置，現況既有跨渠構造物配合渠道拓寬改建，樑底依據計畫堤頂高抬升後，兩岸設置引道20~40公尺銜接至既有農路高程。
海埔排水整治工程之設計亦同時考量水域生物棲息空間及環境綠美化，採複式斷面自然砌石邊坡，兩岸種植蔓藤類植物覆蓋邊坡以營造綠美化空間，提高整體視覺景觀，並同時考量生態友善措施，避免堤頂高過高導致野生動物落入渠底無法爬出，計畫渠道全線每50公尺設置一座生態廊道，引導野生動物至迴避人類活動頻繁之區域。
面對極端氣候的影響，海埔排水透過全線治理規劃改善拓寬後，將徹底改善埤上游聚落水患之問題，另配合海埔排水沿線防汛道路之設置，可自佳里區嘉南大圳學甲分線旁道路連接至麻豆排水左岸防汛道路以形成便捷的路網，有效提升防汛期間各單位投入搶修搶險的效率，使淹水風險降至最低，提升防洪保護標準(10年重現期洪水通洪能力、25年重現期洪水不溢堤)，使民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，促進民眾對政府施政之信心，同時創造鄰近土地增值效益。