考量南部地區近年極端氣候變化，傳統水資源設施如遭遇嚴重乾旱時將對地區供水造成極大壓力，故中央推動興建臺南海水淡化廠以提升地區供水韌性，目前興建中，預計117年底完成第一期產水每日10萬噸，未來海淡廠產水將透過輸水管線併入自來水管網，由自來水公司統一調度供應做公共用水使用，透過多元水源供給，優化南臺灣水源調度的彈性及供水韌性。
水利局表示，依照中央規劃，海淡廠產水水質於興建契約中已有明確規定海淡水處理後應符合自來水飲用水水質標準，參考澎湖、馬祖等離島地區，及鄰近國家包含新加坡、香港等，其均有建置海淡廠產水供應民生使用，其水質亦均符合飲用水標準，海水淡化產水技術已相當成熟，市府也會要求中央水質符合標準後才供應使用。