在極端氣候影響下，隨著城市發展不透水面積增加，淹水問題亦不可避免是經濟發展的副作用。為強化仁德、永康、東區及南區等區域防汛，台南市長黃偉哲自上任後，積極推動三爺溪排水整治工作，在歷屆縣市長及中央共同努力下，去（111）年底完成主流全線整治，累積已整治超過10公里的河道護岸，並完成6座大型抽水站、改建4座橋梁，大幅削減積淹水面積。
黃偉哲市長表示，治水工作是一棒接一棒，三爺溪整治歷經多任市長及縣長，自他接手賴前市長及李前市長的分期整治策略，以主流整治拓寬、高地截流、低地抽排、阻水橋樑改建等策略，兼顧內外水治理。過去因地形低窪而水患頻傳的三爺溪沿線，堤後低窪區的積淹水情形獲得明顯改善，三爺溪常水位也有效降低，減輕淹水風險，例如萬代橋上游各項改善工程在109年陸續完成之後，逢短時強降雨就易淹水的崑山科大及中華醫大校區，近年已無發生淹水情形。包含校方及當地工業區廠商代表等均多加肯定治水成效。長期策略部分，在中央全力支持下，一次挹注經費約47.7億元進行萬代橋以下至二仁溪匯流口全線整治，於分區同時施工的努力下，終於提前於去年底全數完工，達到10年降雨頻率保護標準及25年降雨頻率不溢堤的目標。
黃市長強調「治水應有效發揮防洪成效，提升國土韌性」，因應氣候變遷現在進行式的挑戰，目前各項治水工程已展現階段性功效，但市府團隊不會因此自滿，會繼續聚焦投入淹水問題改善，並落實災害防制及應變復原工作，努力為市民鄉親撐起保護傘，並持續檢討及精進，全力讓臺南市民安居樂業，營造宜居臺南。