北門區屬易淹水地區，往年淹水災情中以玉港聚落最為嚴峻，每當颱風豪雨加潮汐暴潮影響，時常造成部分低窪住戶數日積淹水，黃偉哲市長責成水利局積極整治玉港里淹水問題，並以2020年「環境永續」治水施政策略針對淹水災區積極辦理整治，不放棄任何一個會淹水的地方，助地方儘早脫離水患。
市府為加強玉港里主要社區西埔內及灰瑤港民眾防洪保護，經積極爭取治水預算獲得經濟部水利署支持，於治水特別計畫核列約1億元預算，採部落防護及導洪工法辦理改善，並計畫於里內佈設合計22部抽水機（合計抽排量達7.9cms），俟治水防護改善工程完成後，對該地區長期以來飽受水患之苦的情形可以大幅改善。
北門區玉港里主要聚落為171線北側西埔內社區及南側灰瑤港社區，保護範圍約35公頃、人口約700人，聚落外圍多為農田或養殖魚塭使用，因地勢低平且排水感潮緣故，若逢豪雨及潮位高漲重力排水不易而漫淹成災，尤以107年0823豪雨期間，社區多處最大淹水深度逾30公分，淹水深度最深達50公分，甚至漫過市道171線影響通行，市府雖調度移動式抽水機組緊急支援，因未能有效阻隔道路側溝冒孔倒灌，仍造成區域長時間積淹水情形，亦為全市最晚退水之淹水災區。
為此，水利局檢討淹水原因並以0823豪雨淹水規模，將玉港治理改善對策主要分為三項，一是將171線側溝設置專管截流上游雨水，將其分洪至永隆溝排水宣洩，以改善外水冒孔倒灌情形，二是鞏固社區聚落第二道防線避免因農田及魚塭蓄洪漫淹，三則是加強抽水機組容量及配置緊急供電系統，確保災中防汛機組運轉正常。針對聚落防護改善，目前水利局刻正積極辦理導洪箱涵工程，預計於109年底前完工，而目前即將施作市道171線截流涵管埋設，施工期間將佔用部分車道影響行車動線，後續將請用路人行經相關路段宜減速留意，以維行車安全。
適逢進入汛期，黃偉哲市長要求防汛整備工作刻不容緩，並指示預佈抽水設備，水利局已於玉港聚落區外佈設10台移動式抽水機組，區內佈設8台抽水機組，合計整體抽水量可達5.4cms，以提升社區短延時強降雨承受力，未來計畫再增加2.5cms抽水量，搭配維護管理措施如防潮閘門操作管理、移動式防水擋板使用及排水疏濬工作，相信在多項防洪減災措施聯合運用下，有助於提升玉港地區通過0823豪雨考驗。