102年潭美、康芮颱風造成菁寮排水南岸的頂長、平安里，以及北岸的菁寮、墨林里水患，為解決當地淹水問題，水利局針對菁寮排水南北岸差異特性，採取不同的方案。南岸因地勢較低，故編列4期應急工程施作1.78km護岸與第二道防線達成聚落防護，北岸因地勢較高，但社區內舊排水難以改建，故運用農田水利的灌溉渠作為天然防洪措施，另針對抽水站體進行改善，縮短抽水機操作應變時間，利用重力排特性，達成社區與農田重劃區排水分流，降低聚落淹水風險。
水利局針對菁寮、墨林里(菁寮老街)分階段進行改善，第一階段於105年底改善抽水站體，由原先的抽水機倉庫改建為抽水站體，增設抽水平台，並與後壁公所協調增加一臺移動式抽水機，利用地勢高水頭差特性重力排至菁寮排水，於105年歷次颱風期間通過考驗。
為提高社區防洪標準，第二階段考量原先社區與農田排水匯流，造成回流社區的風險，故編列經費1000萬元，辦理「後壁區墨林地區分流改善工程」，採社區與農田排水分流方式，更改農田排水流向，順帶更新排水設施，預計於106年4月竣工。該案工程規劃、設計與施工期間，水利局多次下鄉溝通、說明治水策略，取得地方信任，竣工後可望提昇社區淹水防護能力，保障民眾財產安全。