近年來由於全球氣候異常，水文極端現象明顯，受災範圍與程度均遠較過去為劇烈，後鎮排水橫跨本市鹽水區汫水里、新營區埤寮里一帶，往年即常因瞬間暴雨或持續豪大雨，造成住宅、農田損害，影響人民生命財產安全。經分析淹水發生主要原因為渠道通水斷面不足及流入工未設置自動水門或舌閥造成周邊淹水，經綜合治水規劃後提出以排水路改善910公尺、流入工改善十一處方式為治理規劃主軸及解決對策。
為有效減低本地區之淹水風險，本府於101年間開始辦理後鎮排水整治工程。完工後已能將後鎮排水外水不易倒灌至週圍農田及住宅區，避免後鎮排水影響的地區淹水。
本府水利局負責用地取得作業，目前後鎮排水後鎮橋段護岸改善應急工程已辦理發包，另ㄧ件後鎮排水復興橋段護岸改善應急工程在積極設計審核中預計102年12月底前工程可發包，於103年5月底前可完工。
本兩件工程完工後，除可容納豪大雨來襲時後鎮排水之大量水流，搭配沿岸之流入工改善可順利排入後鎮排水，進而保護本市鹽水區汫水里及新營區飯埤寮里一帶等沿岸民眾之生命財產安全，避免該地區民眾遭受淹水損失。
面對未來日漸極端的降雨趨勢，本府往後仍將針對本流域積極爭取經費辦理治水工程，以使本流域之淹水風險減至最低，使民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，達到治水、利水、保水、親水、活水之最高目標。