近年來由於全球氣候異常，水文極端現象明顯，受災範圍與程度均遠較過去為劇烈，本市麻豆區總爺排水出口及東北勢排水地勢特別低窪，易受麻豆排水回水及感潮段影響，內水不易排出，每逢重大颱風豪雨來襲時，造成北勢里及北勢國小地區居民、農田災損，影響人民生命財產安全。
東北勢排水長約 1公里，集水面積約263公頃，與總爺排水匯流處之「東北勢排水應急抽水工程」（詳平面圖），本府自籌工程總經費約為2,440萬元，已於104年5月正式啟用，對東北勢排水下游聚落已有效減緩淹水情事，而東北勢排水中上游主要位於麻豆市區東北側，經由農田排水路及雨水下水道匯集流入，目前排水路改善工程有中央經費核列「麻豆區北麻豆中排二排水應急工程」及本府自籌經費「麻豆區北麻豆小排三之一護岸改善工程」、「麻豆區東北勢排水1k+500至1k+600護岸改善工程」及「麻豆區北麻豆中排三災後復建工程」等，工程總經費約為2,350萬元，詳照片一～六），上開工程自105年4月已陸續施工或發包設計中，主要工程內容將土渠或老舊砌石護岸改善為直立式防洪牆或半重力式護岸，使護岸高度提高防止溢堤，渠道加寬疏通瓶頸，避免市區遭受積淹水嚴重災情。
為加速改善麻豆市區排洪功效，中央已核列由營建署辦理「臺南市麻豆區(含麻豆交流道特定區)雨水下水道系統規劃檢討」案，重新檢討研議麻豆地區雨水下水道幹線、側溝及農田排水路排洪功效，以提高市區防洪保護標準，並配合中央流域綜合治理計畫爭取經費，辦理排水整治、疏通瓶頸，俾利降低麻豆市淹水風險。面對未來日漸極端的降雨趨勢，本府日後仍將針對將軍溪排水系統積極爭取經費辦理治水工程，使麻豆地區之淹水風險減至最低，民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，達到治水、利水、保水、親水、活水之最高目標。