為使於颱風豪雨來臨時充分提供砂包給市民做為防淹水使用，水利局隨時加強防汛砂包整備管控，目前已頒佈「臺南市政府防汛專用砂包整備，領用及回收注意事項」做為砂包整備，領用及回收作業程序依據，另也建置有「防災應變專區系統」，透過網路系統隨時了解各區公所防汛砂包存量情形，並定期派河川駐衛警同仁，前往各區公所現地核對數量，以期做到充分準備，有備無患。
水利局積極推動各項治水建設，近年來雖淹水面積已逐年減少，初具治水成效，但由於本市幅緣廣闊，限於治水建設經費龐大，一時不易全面籌措到位，所以對於一些低窪區域，仍可能會出現淹積水情形，所以砂包對某些區域民眾仍然有需要，故水利局於汛期前都會要求各區公所依據101年7月16日發布「臺南市政府防汛專用砂包整備，領用及回收注意事項」文規定適時公佈領取及回收之地點，供民眾自由領取砂包及回收。同時水利局也自行開發「防災應變專區系統」透過網路系統隨時對每次災害事件之公所砂包發放做數量統計，如發現存量不足時，可要求公所儘快補充，能充分提供市民之需要。水利局並定期派河川駐衛警同仁前往各區公所現地核對數量。
目前本市備妥有11萬7仟包的砂包及15萬個砂包袋，於需要時可裝砂補足砂包數量，以供市民領用，水利局除加強相關治水建設外，期望透過防汛準備措施，減少市民減水風險。