「土城仔排水」為「鹿耳門排水系統治理計畫」中第二期治理計畫，工程經費為九千八百萬元。鹿耳門排水系統地區因地勢低且平緩，導致水流速度緩慢造成洪水漫溢。原有土城仔排水河段通水斷面明顯不足及堤岸高程保護不夠，中下游地勢較低漥且排水出口易受潮位影響等因素，每逢豪大雨加上漲潮，內水不易排除，常造成低漥地區積淹水。
水利局說明，經濟部水利署委託該局代辦「綜合流域治理計畫」中「鹿耳門排水系統治理計畫」，鹿耳門排水系統為本市市管區域排水系統，該排水系統地形由東北向西南傾斜，地勢平坦，中、下游河段位屬於感潮區域，颱風豪雨時如逢潮汐漲落，直接影響內水排洪能力，且本流域下游部分低窪地區地表高程低於平均高潮位以下，造成內水排出易受阻。治理計畫中第一階段「鹿耳門排水系統」已幾近完成。期能更降低水患災害，遂辦理治理計畫中第二階段鹿耳門排水幹線支流之一「土城仔排水改善工程」。該工程位於安南區城南里，臨近台十七線濱海公路，鹿耳門天后宮為附近重要名勝。該工程施工長度為750公尺，起點為鹿耳門溪，終點為安清路一段無名橋，並收集上游逕流後排放至鹿耳門排水。本工程將辦理河道斷面拓寬、新建堤防及水防道路，將原排水斷面拓寬，設計標準依易淹水地區治理計畫規定，以10年重現期洪水設計，25年重現期不溢堤為目標。本工程目前在設計階段，將於今年年底發包施工，預計於107年上半年度完工。
水利局表示，將督促承攬廠商在兼顧工程品質與生態環境下進行施工，該段河道現況土堤多為紅樹林覆蓋，考量生態條件下，本案將採用生態工法進行護坡改善，工程完成時不僅可有效增加區域排水斷面，可舒解較易淹水地區水患，減少百姓生命財產之損失，更可為台南市安南區新增一處遊憩景點。