本市後壁區菁寮排水系統因堤防尚未全面建置完成，且八掌溪外水位高，內水排除不易，水利局優先編列三千萬元經費，於菁寮排水出口閘門處設置兩台每秒4噸水量的豎軸式抽水機之應急抽水站，該工程已發包完成並於今(103)年度1月開工。
後壁區菁寮排水遭逢大雨時容易淹水，雨季來臨時居民無不提心吊膽，當地議員及里長亦強烈要求市府儘速核撥經費整治菁寮大排。水利局長李孟諺表示，整治菁寮大排十二公里堤防，需要經費十五億元，市府財政無法負擔，為緩解水患發生，市府希望該菁寮應急抽水站之完成能肩負起颱風排洪功能，有效減輕八掌溪水位高漲，內水無法排出的風險。
該工程站體構造完整，下部為鋼筋混凝土結構，上部為鋼構站房，除設置抽水站體以外，亦施設引水箱涵將菁寮排水引至抽水站，並新設側溝以銜接既有路邊側溝，颱風來時優先抽取堤後農地排水，菁寮水位再高漲改抽取菁寮排水，為一個雙用途抽水站；而為樽節預算，本站亦使用向新北市商借汰換引擎二台，整修後搭配新購之2台抽水機，配合原有防止八掌溪水侵入之八座閘門，可有效改善洪水氾濫情形，提升民眾居住安全。