為改善台南市重點河川鹽水溪及二仁溪水質污染情形，臺南市政府水利局積極向行政院環保署申請4億7仟萬元的工程補助經費，分別在永康大排、三爺溪及港尾溝溪等地進行5處水質淨化場工程設置，可望有效改善鹽水溪及二仁溪水質。
水利局表示，水利局規劃截流鹽水溪支流永康大排的民生污水及工業區排放水至新建之水質淨化設施處理並營造生態溼地，預計每日能截取高達12,500噸永康大排的民生及工業區排放水；同時於二仁溪支流三爺溪及港尾溝溪等地規劃截流仁德排水、保安排水及萬代橋雨水箱涵每日總計33,000噸事業、畜牧及民生污水，藉由礫間淨化現地處理自然工法，淨化河川污染現況，期能改善鹽水溪及二仁溪水質，給當地居民更好的生活品質。
水利局在永康水質淨化工程發包前也積極地與當地居民近距離溝通說明，並了解民眾需求，對於水質淨化廠的設置，能改善長久以來水質惡化的問題，並能將荒地變成公園，提供鄰近區民舒適的休憩空間，獲致當地里長及里民之正面反應。5處水質淨化工程皆已於101年底順利完成發包作業，目前積極準備開工作業中，預計於4月中陸續開工。
水利局更進一步表示，為避免居民擔心處理污水會產生臭味及噪音問題，設計時將淨水單元全面地下化設置，並妥善綠美化上部空間，給民眾全新且舒適的休憩空間。此外，水利局於永康水質淨化場內還規劃生態景觀池、濕地及地下觀察廊道，提供民眾在休憩觀賞之餘，也能了解污水的處理過程，兼具淨水、休閒與教育意義，同時達到宣導水資源保育的目標。
水利局積極投入辦理水質淨化工程，「永康滯洪池水質淨化場」已於去年年底開工，「永康大排水岸生態礫間淨化工程」、「萬代橋生態礫間淨化工程」「仁德排水生態礫間淨化工程」、「港尾溝溪滯洪池水質淨化場工程」分別也將於4月中陸續動工，在政府的努力及居民的支持下，希望能一同營造親水、乾淨的生活環境，造福大台南市居民。