台南市府水利局為解決鹽水、新營區轄內易淹地區淹水問題，先行辦理災害預防工程及治水應急工程，分別為「新營區鹽水排水菜寮橋下游段右岸崩塌預防工程」、「新營區鹽水排水菜寮橋上游段左岸崩塌預防工程」及「鹽水排水菜寮橋段護岸應急工程」。鹽水及新營區的排水問題，為颱風暴雨時，急水溪水位高漲，各排水路短期內無法排出，相對低窪區無法重力排水，排水路堤岸高度不足，容易溢堤部分水路尚未施設堤岸防護，部分排水路寬度不足、逆坡等，造成排水系統不良。鹽水排水系統現況通水斷面寬窄不一、高低不齊，經水理演算後堤岸高度仍不足，易造成低窪區域淹水，應急工程主要整治段為菜寮橋附近渠段。
災害預防工程主要工項：鹽水排水菜寮橋上游左岸及下游右岸護岸改善工程各約100公尺，工程費約800萬元，於102年1月開工，並已於102年3月底完工。應急治理工程主要工項：鹽水排水菜寮橋上游左、右護岸改善工程各約50公尺，工程費約460萬元，預計於102年5月發包開工，預計102年9月完工。本市將逐步建置鹽水及新營地區完整的防洪體系，解決淹水問題並強化經濟發展基礎。