近年來由於全球氣候異常，水文極端現象明顯，受災範圍與程度均遠較過去為劇烈，本市鹽水區及學甲區一帶，往年即常因瞬間暴雨或持續豪大雨，造成住宅、農田損害，影響人民生命財產安全。經分析檢討淹水主要原因為渠道通水斷面不足及急水溪水位過高造成岸內排水內水排出不易，經綜合治水規劃後提出以排水路改善、新建滯洪池及岸內排水直接分洪至急水溪方式為治理規劃主軸及解決對策。
為有效減低本地區之淹水風險，本府於96年辦理「岸內排水排入急水溪疏洪工程」，目前本工程已於97年完工，完工後已能快速將岸內排水之大量水流直接疏洪至急水溪，避免岸內排水下游地區淹水。本府於100年間已向經濟部爭取「易淹水地區水患治理計畫第3階段實施計畫」經費辦理「岸內排水頂洲橋改建工程」。本件工程由經濟部水利署第六河川局負責設計施工及監造，本府水利局負責用地取得作業，本工程案自101年10月開工，於102年12月申報完工，工程內容主要為新建兩垮預力I型樑橋及道路兩側增設護欄、擋土牆、側溝、暗溝等，工程總經費約為55,358,000元整，另用地部份，水利局業於102年12月完成工程用地之協議價購或徵收作業，俾利工程順利進行。
有關岸內排水頂洲橋至中興橋段護岸改善應急工程，市府已分為6標依序辦理改善工程，自102年01月開工，預定於103年7月該應急工程大致可申報完工，工程內容主要為防洪牆、流入工及閘門等，岸內排水護岸改善應急工程總經費約為136,428,000元整。
頂洲橋改建工程及岸內排水護岸改善應急工程之完成，除可容納大雨來襲流入岸內排水搭配急水溪疏洪工程，使岸內排水之洪水量迅速流至急水溪外，於岸內排水水位高漲時，不受頂洲橋樑底太低而影響岸內排水排洪效率，進而保護本市鹽水區及學甲區等急水溪流域民眾之生命財產安全，避免該地區民眾遭受淹水損失。
為加速推動流域整體治理，中央已通過「流域綜合治理計畫（103年至108年）」，本局亦將新田寮排水系統（岸內排水及鹽水排水）列入計畫內辦理治理工程，以期達到區域排水防洪頻率保護標準。 面對未來日漸極端的降雨趨勢，本府往後仍將針對新田寮排水系統積極爭取經費辦理治水工程，以使鹽水及學甲地區之淹水風險減至最低，使民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，達到治水、利水、保水、親水、活水之最高目標。