水利局為使水患防護網更加縝密，除積極推動流域綜合治理計畫加強防洪工程與設施的建設外，更透過對各區公所的水利考核，來檢視各項水利業務執行情形，106年度的水利考核經統計績優的各組前三名分別為甲組第一名仁德區，第二名東區，第三名安平區，乙組第一名麻豆區，第二名學甲區，第三名新化區，丙組第一名白河區，第二名龍崎區，第三名楠西區。水利局將安排於區長會議請市長頒發獎狀以玆鼓勵。
縣市合併後，由於幅員廣闊，地形複雜，各區域防水防洪條件亦不一樣，水利局除持續針對各水系的防洪條件，設計各種應急工程加緊治理外，更與37區公所緊密結合，今(106)年度水利業務經費就設算給公所的約1.5億，辦理其轄內提報區域排水、雨水下水道清淤、下水道開孔檢查、水閘門操作維護及辦理移動式抽水機操作等工作。水利局與各區公所的定期溝通平台會議亦還會檢討清淤、開孔檢查等費用，如有不足水利局還會再適時補助。
本次水利考核依各區人口數分為甲、乙、丙三組，甲組人口數超過5萬人有11區，乙組人口數超過2萬至5萬人有15區，丙組人口數未達2萬人及土石流有潛勢區域有11個區，每一組考核小組均由水利局1位帶官及3位資深工程司組成，秉持公正、客觀、嚴謹的態度給予逐項評分，由於評分成績都相當接近，顯示各區公所對該工作的重視，水利局透過考核小組的現地考核，來提醒各區公所所應再加強之項目，期望使整個第一線防災更落實，更有效降低本市淹水風險。