後鎮抽水站位於臺南市鹽水區汫水里後鎮排水出口閘門北岸，後鎮排水及八掌溪白沙屯堤防間，後鎮抽水站工程於106年9月開工，施工期近18個月，已於今年度2月28日完工, 工程經費達8833萬 ,對當地居民生命財產安全多一層保障。
後鎮抽水站範圍包含容積為33,700噸調節池1座、地下2層地上1層的抽水站主體結構物以及週邊設施等，主站體1F設置有中控室供操作人員進駐、電氣室設置有控制盤體負責站體設施電氣控制、發電機室設置1台40KW柴油引擎發電機作為市電停電時緊急供電使用、動力機房配置3組3CMS豎軸抽水機組和引擎機組以及減速機及傳動組件，站區內還有1座15,800公升貯油槽、2台15HP清污泵、消防水池、3扇進水閘門及3台撈汙機等設施，另外八掌溪堤外出水管口設有舌閥、消能工及出水渠道，工程經費達8,833萬餘元。
水利局依照經濟部水利署於易淹水地區水患治理計畫規劃設置「後鎮抽水站」，用以解決後壁區竹圍後社區之農田低地一帶淹水問題。該處主要因為後壁區竹圍後社區之農田低地，長期因八掌溪外水位高漲，使得內水排除不易，每當豪雨發生期間，該處低窪地區時有淹水情事發生。後鎮抽水站設置總抽水量達9cms之抽水機組，該處集水面積達270公頃，主要收集抽排低地區無法自然排除之內水，經由低地集水路收集暴雨期間洪水，統一由竹圍後中排一溢流入抽水站調節池後，再透過抽水站以抽排之方式排入八掌溪。
目前後鎮抽水站已投入防洪排水運轉行列，平日委由抽水站代操作廠商人員進駐管理，並於颱風豪雨期間負責操作抽水機抽排水，保障當地人民生命財產安全。