安南區因地形關係，受海水潮汐影響大，若遇上潮位很高，便常發生積淹水事件。因此，針對安南區整體治水規劃，市府採用因地制宜多元的總合性治水方式，包含渠道拓寬濬深、雨水下水道及抽水站等，自黃市長上任以來已投入各項改善措施經費約33億元，佔整體治水經費約17%。
水利局說明，為避免外水水位過高影響社區排水，目前安南區共設有草湖寮、海環、海尾寮站等11個大型抽水站，針對本淵寮排水流域新建海東D2抽水站，近期已完成並投入使用，於本年度汛期發揮初步功效。另針對海尾寮排水流域新建安中抽水站，預定113年底可完工。期望透過抽水站新建工程改善安南區低窪地區聚落易發生積淹水之問題。有鑑於極端氣候影響，水利局亦配合經濟部水利署逕流分擔理念，如規劃於安中路一段南北側之大愛與頂好公園，利用公園及停車場公有土地，新建地下滯洪池，用予吸納瞬間強降雨，於洪峰過後再行排出。
過往逢大雨必淹同安路、長溪路一段東側、總頭寮聚落等易淹水地區，透過近幾年來同安路D幹線箱涵、新建長溪路A幹支線箱涵及十三佃聚落排水箱涵等改善工程，已發揮初步成效，達到加速排洪降低低窪聚落淹水潛勢。目前水利局持續辦理六塊寮排水、海尾寮排水等排水、土城仔排水防潮閘門等治理工程改善工程，第六河川分署持續辦理曾文溪排水改善工程，均係由下游往上游治理，期望透過工程措施來達到區域排水10年重現期之保護標準。
水利局表示，黃市長指示市府全力投入改善工程，目前持續向中央爭取3.3億安南區治水工程補助，以推動並逐步完善安南區地勢低漥地區之治水策略，以發揮成效。