海尾寮排水為臺南市安南區市管區域排水，上游源自安南區總頭寮附近，流經十三佃、海尾寮等聚落後，於台17線海尾橋下游540公尺處匯入曾文溪排水。
海尾寮聚落約位於海尾寮排水右岸，海佃路二段（台17甲）以下之範圍，聚落主要倚靠HG幹線以及D幹線兩條雨水下水道系統，收集地表逕流後，排入海尾寮排水；聚落因先天地勢低窪，適逢暴雨及滿潮期間，海尾寮排水水位高於聚落地盤高程，且雨水下水道出口無法重力排水，便容易發生嚴重積淹水災情。
水利局於107年初甫完成排水系統整治（0k+000至2k+305），並在整治工程用地範圍內（0k+540~2k+305），開闢右岸滯洪池以及D幹線分流雨水下水道，滯洪池集水範圍包括海尾寮聚落D幹線（集水面積29.4公頃）及HG幹線（集水面積18.6公頃），工程全線完成，於今年8月23日豪大雨明顯改善海尾寮聚落之淹水情形。
今以經費2,500萬元辦理「臺南市安南區海尾寮HG幹線抽水站工程」，工程內容為一座抽水站房、一處抽水井、一組柴油引擎發電機及三部1cms沉水式抽水機組，工程完工整合搭配既有HG幹線及D幹線將提高海尾寮聚落防洪能力，現工程進度為上網公告階段，預計於107年12月辦理開工事宜，108年8月底完成。
水利局進一步說明，本工程及海尾寮排水系統整治後，其總保護面積將可達約50公頃並可保護人口數約三千人，以改善當地低窪淹水沉苛。