為改善柳營區五軍營社區及大腳腿集水區水患問題，水利局陸續爭取逾新臺幣2億元，興建大腳腿排水出口閘門、背水堤及護岸工程、五軍營庄內排水應急工程、五軍營改建工程、設置抽水設施等綜合措施，預計108年底可完成，保障人民生命產財安全。
五軍營社區位處龜重溪及大腳腿排水兩股水流匯流處，龜重溪堤防構築完成後，水利局為避免龜重溪水位頂托倒灌，導致嚴重水患災情，即於98年爭取經費辦理大腳腿排水出口閘門新建工程，於大腳腿排水出口處設置閘門完成抵禦龜重溪外水倒灌課題。並爭取「流域綜合治理計畫」項下經費辦理「五軍營庄內排水應急工程」完成五軍營社區排水收集水路，完成階段性水患改善應急措施。
惟大腳腿排水於龜重溪水位高漲時，將造成水位擁高，恐漫淹危及社區。水利局爰依98年「易淹水地區水患治理計畫－台南縣管區排吉貝耍及大腳腿排水系統規劃報告」，於105年順利爭取「前瞻基礎建設計畫」之水與安全項下經費新臺幣6,000萬元，辦理大腳腿排水五軍營橋下游段改善工程，完成背水堤新建。並庸續爭取1億5,130萬元，辦理五軍營橋改建工程、大腳腿排水五軍營橋上游段改善工程、大腳腿排水上游段改善工程，俾拓寬水路增加通洪斷面並提高堤頂高程，避免大腳腿排水溢淹至周遭農田及社區。相關工程預計將於108年底前陸續完工，屆時可整體改善社區外水倒灌問題。
鑒於五軍營社區地勢相對低漥，為改善颱洪期間內水無法重力排出問題，水利局已於大腳腿排水出口處設置4部移動式抽水機(總抽水量每秒1.2噸)，且為再提昇社區抽排效益，亦計畫於社區排水收集水路末端設置4部移動式抽水機(總抽水量每秒1.6噸)，預計今(108)年8月底前完成佈設。綜整排水系統總抽排量約達每秒2.8噸，屆時可有效減輕五軍營社區淹水風險。