海尾寮排水為臺南市管區域排水，上游源自安南區總頭寮附近，流經十三佃、海尾寮等聚落後，於台17線海尾橋下游處匯入曾文溪排水；因位於感潮河段，排水能力受潮汐漲退影響，且因歷年漁塭填築致使渠道寬度縮減，使得下游渠道通水斷面不足，每逢暴雨中、上游聚落便容易有積淹水情形。
水利局表示，為能有效減少海尾寮排水周邊社區淹水情事之發生及為兼顧排水防洪情況下，於102年度起先行完成海尾寮排水0k+000~0k+540下游段整治工程，再於105年度起提列2億7,000萬工程經費及約5億3,000萬之用地徵收經費，持續辦理海尾寮排水0k+540~2k+305上游段之整治工程並將其排水護岸加高至EL.3.15公尺，其設計更將基樁深入堅硬砂層，以鞏固河防安全，水利局強調為使該護岸朝向多功能使用目標，除開闢兩側水防道路及自行車道提供駐足親水賞景，更預留約6萬噸之帶狀滯洪池空間及堤頂綠帶營造社區環境，並於渠底拋石營造多孔隙水域環境，提供水生動物棲息，同時兼顧綠帶環境營造及減少周遭社區淹水情事的發生，該排水整治工程在水利局戮力督導監工及承攬廠商配合趕工下，已於106年12月底完成。
水利局說明，經整治後所完成之護岸不但加強海尾寮排水防洪功能，更增加總保護面積約50公頃及鄰近社區之保護人口約三千人，不但使得民眾生命財產獲得保障更能提供安南區市民舒適之休憩、散步、慢跑運動場所，達到排水路多功能整治之目標。