市府為提升將軍區青鯤鯓地區之整體防洪保護，積極持續向水利署爭取「前瞻基礎建設計畫」辦理「將軍區青鯤鯓社區部落防護治理工程」，獲核列預算4,500萬元，水利局已完成規劃設計作業，並於108年上半年度進行2次工程招標，惟仍未能順利發包，經重新檢討工項及營建物價，已增籌400萬元市府配合款，即總預算4900萬元再次上網招標，預計108年6月完成發包，盼以加強青鯤鯓社區治水防洪能力，保障市民生命財產安全。
青鯤鯓社區及青山漁港為本市海線重要的觀光遊憩景點，有鑒於地勢低平且常受暴潮影響，前期已建置完成東南隅青鯤鯓抽水站4.8cms，及西北隅設置簡易抽水站0.6cms，以因應先天重力排水不良問題，然近年氣候變異強降雨風災頻傳，受災範圍與程度遠較過去劇烈，水利局即向中央爭取經費支持，計畫辦理沿線護岸結構及高程補強約586公尺，鞏固抵禦暴潮之防線，針對市場內購置電動伏倒式不鏽鋼水閘門約37公尺，發揮兼具防洪應變及維持市場平時作業動線之需要，另為解決北側蒐集水路宣洩不及情形，除預計將進行蒐集水路延伸，亦將增購0.3cms移動式抽水機組及20HP沉水式機組各2部，以多點抽水方式提高內水抽排效率，預期三大重點措施可將整體防洪保護提升更加完善。
本工程截至目前雖歷經兩次招標不順，水利局已立即檢討研議並籌措400萬元預算挹注，預計108年6月底前完成發包，屆時配合本府農業局災害復建工程｢107年8月豪雨將軍區青山漁港北碼頭、魚市突堤南碼頭及中碼頭災後復建工程｣之碼頭設施改善，一併打造青鯤鯓社區抗洪防線，可望大幅改善地方淹水災情，促進地方特色發展及市民宜居。