為改善虎頭溪排水沿岸積淹水問題，臺南市長黃偉哲積極向水利署爭取整治經費，110（去）年底著手辦理「虎頭溪排水護岸新建工程」，工程經費約1億元，整治河道長度約0.8公里；黃市長表示，水利署111（今）年8月再同意辦理虎頭溪排水離子尾橋至穗芳橋河段的排水整治工作，工程經費約1.1億元，整治河道長度約0.5公里，以藉此加速並強化區域排水能力，並降低當地民眾生命財產損失。
水利局說，過去的莫拉克風災，在新化地區造成30-180公分的淹水，其中，虎頭溪是影響新化地區防洪、治水安全的重要溪流，在上游，最窄的地方大約4公尺，現在要拓寬至20公尺；下游更要拓寬至50公尺，河道拓寬後，我們的排水就能更順暢。
水利局進一步說明，過去市府已投入5.08億元經費，完成護岸3.2公里及橋梁改建工作，以往新化市區及新和庄等淹水熱點現在也鮮少淹水，治水成效已逐步顯現。110（去）年底已著手辦理「虎頭溪排水護岸新建工程」，工程經費約1億元，改善河道長度共0.8公里，相關工程已陸續於111年1月開工，預計112年3月底前完工；今年8月水利署也同意辦理虎頭溪排水離子尾橋至穗芳橋的排水整治工作，工程經費1.1億元，整治河道長度約0.5公里；工程已於8月底上網公告，預計9月13日開標。此外，下甲橋改建設計工作及虎頭溪治理計畫檢討也同步進行中，相關工程完成後，應可改善整體虎頭溪排水防洪能力，以往讓人詬病的防汛道路未能連貫的情形也可一併改善。
黃偉哲市長表示，很感謝中央水利署能夠支援虎頭溪一、二期經費，約6.5億元治水經費，讓虎頭溪排水整治可以及時展開，也希望工程能夠順利早日完工；而虎頭溪整治仍須27.6億元經費，也會持續向水利署爭取，讓新化地區的民眾減少淹水的困擾，讓民眾可以更加安心、生活更加舒適。