市長黃偉哲相當重視大台南治水，向水利署積極爭取前瞻計畫經費，終獲水利署補助1,150萬元辦理機組改善，將原本菁寮抽水站內兩部老舊柴油引擎機組汰舊換新，原兩部柴油引擎係於民國102年時為樽節經費，採用新北市汰舊整修之兩部老舊引擎，其機齡均已達30年以上，使用上有故障風險高或維修零件難以購置等狀況，市長為避免讓菁寮陷於防汛風險之中，特別指示水利局辦理後壁區菁寮抽水站設備更新應急工程，目前兩部機組皆已更新完畢，準備於汛期間發揮效益。
水利局表示，後壁區菁寮抽水站係於民國102年建置，在用地僅0.1公頃下配置2台4cms(噸/秒)抽水機組，站址位於菁寮排水匯入八掌溪前之右岸，主要為排除菁寮排水系統低地內水，集水區主要為農田地段，保護面積約171公頃，站內現有2台柴油豎軸式抽水機共8cms(噸/秒)，並以1部40KW發電機供站內緊急用電，其中站內2部柴油引擎皆為新北市汰舊整修再利用，機齡約35年，因老舊機組承受較高風險且有無預期損壞之疑慮，故辦理「後壁區菁寮抽水站設備更新應急工程」，其主要工程內容為更新兩部老舊柴油引擎，契約金額958萬元，於108年5月29日開工，並於109年2月22日完工。
水利局表示，老舊抽水站機組更新為近年水利局持續不斷進行之工作，針對已無修繕效益的機組設備進行汰舊換新，不僅確保抽水穩定性，也可避頻日益升高的維護成本，水利局將定期檢討既有設備抽水效能及長期使用效率，保障居民之生命財產安全。