水利局說明，針對已完成污水下水道用戶接管之地區，考量市民生活需求，水利局設立24小時專線(06)2980263處理污水下水道問題，若為緊急案件，有嚴重阻塞致影響民眾環境衛生時，於接獲通報起24小時內督促廠商辦理清除改善完畢；其餘也於5日內通知管線維護廠商進場施作完畢。水利局亦製做通報專線磁鐵，交由各工程標案施工範圍之里長，使里內若有下水道問題能迅速通報本局處理改善，以維持下水道功能正常運作。
污水下水道為國家基礎建設，更是新臺南十大旗艦計畫之一，不僅可以改善都市環境衛生，防止河川水域污染，更可以成為永續利用的資源。故確保污水管線暢通以利家庭等廢水由污水下水道匯集，再送到污水處理廠處理後流入河川或海洋，避免造成污染；或者回收再利用，成為可永續循環的再生水資源是極為重要的事。
水利局強調，污水下水道倘若用戶端污水管線阻塞，極容易滋生蟑螂、蚊子、老鼠等亦將造成污水無法流入收集管線處理，影響居家生活品質與環境衛生。當用戶接管住戶發現排水阻塞或流速變慢時，可先以下列方式處理：1.將清潔孔打開，並用鐵件將阻塞之雜物取出並將附著於管壁物清除，後用清水沖洗。2.若發現為油脂造成之管線阻塞，可先以熱水沖洗污水管線以溶解油脂減輕阻塞情形。3.倘上述方法仍無法排除，表示非該用戶端阻塞，可通報臺南市民服務熱線1999或通知臺南市政府水利局派員協助處理。
水利局表示，綜合污水管線阻塞原因，絕大部分與用戶使用習慣有關，其中油脂造成之阻塞佔比例最多。故排放高油脂污水之營業場所（如餐廳、旅館等）應裝設油脂截留器，務求自源頭減少油脂排放，以避免含油脂污水長期產生皂化現象，造成管壁結垢、堵塞不通，妨礙附近用戶排水暢通。若無設置油脂截留器者，目前暫時不直接進行接管並現場設置預留管，俟完成裝設油脂截流器後再行接入公共污水下水道系統。水利局也呼籲一般用戶，廚房與餐具之油脂可用紙巾擦拭，以減少清洗所排放之污水油脂量，維持下水道功能正常，避免油脂凝結造成污水管線阻塞，影響環境衛生。
污水管線之維護與管理需要用戶端與政府的配合，也惟有保持污水管線暢通，污水下水道建設才能發揮最大效益，不僅保護我們的生態環境、美化家園，提升國民的生活品質，也有助於提升國家形象及競爭力。