臺南市長黃偉哲認為，治水不能因旱象就鬆懈，因此向中央爭取經費，積極辦理「佳里區海埔排水治理工程」，預計施作1,689公尺護岸，由下游往上游分段整建。
水利局表示，海埔排水為將軍溪排水系統之麻豆排水的支流(路流長約1.725公里，出口排入麻豆排水)，受到排水路通水斷面不足、河道淤積、橋梁梁底過低及堤岸高程不足等因素影響，每逢颱洪期間，常因外水頂托導致溢頂漫流，造成上游社區聚落淹水。
為改善海埔排水排洪能力，經評估需採系統性治理改善，計畫全線拓寬(改善後斷面寬度約10~12公尺，整治長度約1,300公尺)。目前提報水利署前瞻基礎建設計畫水與安全第5批次防洪綜合治理工程，施作長度約640公尺，經費合計1億506萬元(用地費2,856萬元、工程費7,650萬元)。另前瞻基礎建設計畫水與安全第6批次防洪綜合治理工程，水利署已於110年4月9日初審經費4,900萬元(用地費3,900萬元、工程費1,000萬元)，將擇期辦理公聽會後並續辦用地取得作業。
水利局最後表示，目前海埔排水整治採複式斷面自然砌石邊坡，並同時考量生態友善措施，計畫渠道全線每50公尺設置一座生態廊道。整治工程完工後，可保護上游社區聚落約2000人，保護面積約為91公頃。施工期間可能造成民眾不便，仍有賴民眾配合。