隨著全球暖化日益嚴重與傳統能源快速耗竭，綠色產業儼然成為全球經濟新亮點。為此，中央致力推動沙崙智慧綠能科學城建設計畫，臺南市長黃偉哲亦視其為智慧城市發展之先驅，全力配合推動公共建設。其中，臺南市政府水利局協助綠能科學城建置污水系統，已於民國109年底完成，可望促進綠能產業聚落發展。
為促進綠能產業發展，提升產業競爭力，以強化能源安全，創新綠色經濟並實現環境永續，行政院105年正式宣布建置臺南沙崙智慧綠能科學城，臺南市政府配合辦理建置污水系統及部分聯外道路。
水利局說明，為配合沙崙智慧綠能科學城之營運時程，水利局於106年7月6日獲行政院於前瞻計畫「科學城低碳智慧環境基礎建置-公共建設部分」核定7.93億元，辦理污水系統建置。108年6月完成沙崙高鐵特定區內既有管線內部檢視及評估堪用狀況總長度約21.2公里、既有管線整建總長度約14.5公里及既有人孔與陰井整建約152座，並於109年底完成8.3公里污水專管之建置及全區域通水。
本區污水系統為收集高鐵特定區內單位(如綠能科技聯合研究中心、綠能科技示範場域、中央研究院南部院區、智慧綠能循環住宅園區、大臺南會展中心、臺灣智駕測試實驗室及三井Outlet等)及區外沿線單位(如臺南看守所、臺南監獄及大潭社區之污水系統)之民生污水送往仁德水資源回收中心處理，預計可收集約22,000 CMD污水量，使綠能科學城各進駐單位不需自行設置污水處理系統，減少民生污水流入二仁溪流域，改善周遭流域及分洪道水質並提升住戶生活品質，達到民政雙贏的業界發展。