近年來由於全球氣候異常，水文極端現象明顯，受災範圍與程度均遠較過去為劇烈，本市麻豆區埤頭排水因地勢低窪，易受麻豆排水回水及感潮段影響，內水不易排出，每逢重大颱風豪雨來襲時，易造成埤頭里地區積淹水，影響人民生命財產安全甚鉅。105年0927梅姬颱風來襲，連日豪雨造成麻豆排水水位高漲不退，埤頭排水雖無發生溢堤，其沿岸聚落之內水無法靠重力排出，需完全仰賴抽水機組日夜連續操作抽排；經多日強降豪雨，上游地區之雨水迅速流至埤頭里永安宮（地勢最低窪），使永安宮水位迅速上升，造成抽水機排洪不及、機組浸水等積淹水災情現象。
有鑑於此，本局近年積極推動各項水利建設，淹水風險已有大幅改善，但仍有抽水能量不足尚需補強，故本局提出「臺南市易淹水地區急需改善工程」向中央爭取經費，為求時效，本局已先行辦理測設工作，有關麻豆區易淹水地區急需改善工程-「麻豆永安宮閘門工程(含抽水機)」，主要工程內容於埤頭里永安宮防洪牆外增設前池、抽水平台、自動與直立式閘門及移動式抽水機0.3cms * 4台，另於沉水式站體新建抽水站廠房及增加發電機組2組等，核定經費為2150萬元，並於107年1月申報開工，預計於107年10月完工使用，考量汛期將屆，已請廠商配合積極趕工並將臨時擋水設施（鋼版樁及太空包）圍堤完成，加強整體防汛準備工作。
埤頭排水為麻豆排水重要支流之一，埤頭排水系統總長3.8公里，前期共核定12件工程皆已完工，工程總經費7億7,000萬元，完成後不僅埤頭排水治理河道斷面拓寬，並將渠道內之土方、舊堤清淤拆除，提昇排洪效益，同時再配合「麻豆永安宮閘門工程(含抽水機)」，即可加速將內水迅速排出，屆時將使埤頭里聚落居民避免遭受淹水災損。
面對未來日漸極端的降雨趨勢，本府日後仍將針對將軍溪排水系統積極爭取經費辦理治水工程，使麻豆地區之淹水風險減至最低，民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，達到治水、利水、保水、親水、活水之最高目標。