市府為改善北學甲市區水患災情，將計畫採蓄洪及機械抽排工法，經積極向內政部營建署爭取經費挹注，獲得支持且分採短、長期辦理，核定總經費合計7億1,310萬元，其中於108年汛期前業已完成短期應急站工程，在颱風及豪大雨期間，為北學甲市區發揮防洪功效。
北學甲市區雨水下水道主要可分為法源排水區及山寮排水區(M幹線)，因地勢平坦低窪且下游區域排水受感潮影響，每逢颱風豪大雨期間易受外水頂拖，常造成內水無法重力排水，進而導致部份地區(如學甲工業區)發生積淹水情事。
有鑑於此，經通盤檢討將採蓄洪及機械抽排工法，在積極向內政部營建署爭取經費補助下，獲得支持並分採短、長期辦理，短期應急方案採新建引水箱涵並搭配移動式抽水機組方式，分別於法源排水區及山寮排水區設置3cms(0.5cms抽水機6部)應急抽水站，執行經費約4.160萬元，工程業於108年汛期前完工，抽水機組亦皆已設置完備，經丹娜絲颱風及豪大雨期間，皆未有積淹水災情發生，為北學甲市區發揮防洪功效。長期治理方案則依「臺南市學甲區雨水下水道系統檢討規劃」內容，計畫新建16cms法源抽水站及12cms山寮(M幹線)抽水站，並搭配調節池蓄洪，核定經費分別為4億1,350萬元及2億5,800萬元，目前刻正進行用地取得作業，同時進行工程設計事宜，預計今(109)年4月完成工程招標程序。
面對未來日漸極端的降雨趨勢，日後仍將積極爭取經費辦理雨水下水道及區域排水改善工程，使學甲市區之淹水風險減至最低，民眾早日脫離淹水之苦並營造自然安全的水環境，達到治水、利水、保水、親水、活水之最高目標。